目前大型醫藥生產企業生產設備已基本實現自動化，大量采用自動立體庫。在醫藥流通領域，隨著我國醫療體制改革的不斷深入，醫藥分開、OTC用藥（非處方用藥）與處方用藥分開，隨之帶來的是醫藥流通行業運作模式的轉變，許多醫藥流通企業在積極探索建設自己的醫藥配送物流系統。從醫藥生產企業的原料、輔料、包材、半成品、成品、備件等物流系統到醫藥配送企業的物流配送中心都涉及自動立體庫。